SAGIR est un réseau de surveillance en continu des maladies de la faune sauvage. Tout au long de l’année, il enregistre des épisodes de maladie ou de mortalité chez les oiseaux et les mammifères sauvages. Cette page présente chronologiquement les événements détectés par le réseau SAGIR, rapportés par les interlocuteurs techniques départementaux.
Date : Octobre 2012
Mortalité groupée de tourterelles turques dans les Pyrénées-Orientales
En octobre 2012, deux communes des Pyrénées-Orientales sont concernées par une mortalité importante de tourterelles turques. Sur l’un des sites, plus de 50 cadavres ont été découverts en l’espace de 15 jours sur le terrain d’un particulier dans un contexte d’agrainage. Un spécimen vivant a été transmis au LDAV66. L’examen nécropsique n’a révélé aucune lésion macroscopique. Mais la confrontation des commémoratifs de terrain, du contexte sanitaire du département et des résultats d’autopsie ont permis d’orienter le diagnostic vers la maladie de Newcastle. Un paramyxovirus aviaire de type 1 variant pigeon a été mis en évidence, qui peut être considéré comme pathogène pour la tourterelle turque et potentiellement pour d’autres espèces (poulet/dinde).
Date : Septembre 2012
Mortalité groupée de pigeon ramier dans la Manche
En septembre 2012, une mortalité groupée de pigeons ramiers présentant des lésions cutanées a été déclarée. Un pigeon ramier a été autopsié et l’histologie a permis de mettre en évidence des lésions fortement évocatrices d’une infection à poxvirus aviaire. La forme présente sur cet animal correspondrait à une poxvirose sèche ou cutanée. Ces lésions ne présentent aucun risque zoonotique.
Date : Juillet 2012
Mortalité groupée de merles noirs en Côte-d’Or
En juillet 2012, une mortalité groupée de merles noirs immatures a été déclarée dans le département de Côte d’Or. Les individus trouvés encore vivants présentaient des difficultés à voler, des problèmes d’orientation. L’examen nécrospique a révélé des lésions non caractéristiques d’une maladie en particulier. Trois semaines plus tôt, plusieurs incidents de mortalité groupée de verdiers d’Europe ont été déclarés pour lesquels les causes classiques de mortalité (trichomonose, salmonellose..) ont été écartées. Etant donné la sensibilité du merle noir et des fringillidés au virus Usutu et le contexte épidémiologique décrit en Allemagne, les flavivirus ont été recherchés.
Le virus Usutu, le virus West-Nile et les virus de l’IA n’ont pas été mis en évidence sur les échantillons transmis au LNR de l’Anses. Les étiologies responsables de la mort des merles n’ont pas pu être identifiées à ce jour.
Date : Juillet 2012
Mortalité groupée d’oiseaux en Charente
Au cours des mois de juillet et août, un incident de mortalité suraiguë de verdiers d’Europe (jeunes et adultes) et tourterelles turques après distribution de graines moisies épandues à même le sol (mélange de tournesol et millet) a été déclaré. La mortalité semble s’être stoppée après retrait des graines. Les commémoratifs confrontés aux résultats d’autopsie ont orienté le diagnostic vers la piste des mycotoxines. Le LDAV16 a donc transféré des échantillons de graines au LDAV40 pour recherche d’aflatoxines, ochratoxine, Don, zéaralénone, fumonisine. Les teneurs en DON (200ppb) (et en Zéaralénone, 35 ppb) retrouvées ne semblent pas pouvoir expliquer, à elles seules, une mortalité brutale chez des oiseaux. Toutefois, il existe un grand nombre de mycotoxines potentiellement produites ; et toutes les mycotoxines ne sont pas dosées en routine. La piste des mycotoxines reste cohérente aux vues du contexte éco-épidémiologique
Date : Février 2012
Mortalité massive de bécasses des bois pendant la vague de froid
En février 2012, plus de 200 bécasses ont été retrouvées mortes en France suite à la vague de froid qui a sévi dans la 1ère quinzaine de ce mois. Des cas de mortalité ont été répertoriés dans 34 départements situés dans 11 régions différentes : jamais, dans les précédentes vagues de froid en France, autant de spécimens n’avaient été retrouvés dans autant de lieux (voir carte), du Nord-Pas-de-Calais au Languedoc-Roussillon, de l’Aquitaine à Rhône-Alpes. Seules la Corse et la Bretagne, épargnées par la rigueur de ce froid n’ont pas enregistré de cas de mortalité. De surcroit, il est important de préciser que trouver un cadavre de bécasse en nature est peu banal car très difficile, nous avions pu faire cette constatation lors d’études avec des oiseaux équipés d’émetteur. Les bécasses avaient atteint des poids extrêmement faibles proches de 200 gr avec une masse musculaire fortement entamée.
Il est cependant difficile d’estimer pour le moment l’impact de cette mortalité sur les populations de bécasses ; cependant, les suspensions de la chasse sur la quasi-totalité du territoire français, dans cette période particulièrement critique pour les oiseaux, ont permis de ne pas ajouter un autre facteur de mortalité (données Réseau Bécasse, réseau ONCFS/FNC/FDC).
Date : Avril 2012
Mortalité groupée d’oiseaux marins en Charente-Maritime
En avril 2012, la LPO alertait le réseau SAGIR d’un incident de mortalité groupée d’amplitude anormale d’oiseaux marins en Charente-Maritime. Une centaine d’oiseaux de plusieurs espèces ayant des comportements alimentaires différents (immatures et adultes) a été déclarée se répartissant de la façon suivante : principalement des guillemots de Troïl, quelques macreuses sp. , quelques fous de bassan et un pingouin torda , mais ce chiffre est probablement largement sous-évalué. L’examen nécropsique réalisé par le laboratoire LASAT révèle un bon état corporel, aucune trace de traumatisme apparent, aucune trace de noyade, un gésier vide, l’examen étant rendu difficile du fait du séjour des cadavres dans l’eau. Les résultats épidémiologique et nécropsique suggèrent un épisode aigu à suraigu d’origine traumatique ou toxicologique. Les enquêtes menées par les services départementaux de l’ONCFS n’ont pas révélé de perturbations acoustiques particulières ni de pollutions au moment de l’incident. Des investigations sont toujours en cours pour déterminer l’origine de cet incident.
Date : Mars 2012
Mortalité de sangliers et lapin de garenne en Charente
En mars 2012, en Charente, une mortalité groupée de 7 sangliers et 1 lapin de garenne a été déclarée. Les animaux ont été retrouvés morts le long d’un cours d’eau, espacés de 150 m. L’épidémiologie de l’incident oriente vers une mortalité suraiguë des animaux, qui présentaient une épistaxis et un prolapsus rectal. Après enquêtes de l’ONCFS et de la FDC, 17 animaux au total auraient été découverts morts. 1 sanglier non issu de la mortalité groupée a été transmis au LDA16. Le cours d’eau au moment des faits est en voie d’assèchement, avec un mince filet d’eau reliant des nappes d’eau dormantes. Le débit principal du cours est constitué principalement par le débit du rejet d’une lagune en amont de la mortalité.
Aucune cyanobactérie ni activité toxinique n’a été mise en évidence par Aqua gestion dans le cours d’eau. En revanche l’analyse du rejet de la lagune a mis en évidence une très forte population de Cyanobactéries (30 millions de cellules/ml).
Aucune activité toxinique n’a été mis en évidence dans la lagune ni sur matrice animale (sanglier). Toutefois des concentrations très élevées d’H2S dissout ont été mises en évidence dans le rejet. La piste d’une intoxication par H2S reste cohérente étant donné l’épidémiologie de l’incident et les symptômes décrits. Toutefois une intoxination ne peut être écartée.
Des investigations sont en cours pour étudier la présence de H2S sur le poumon du lapin.
Date : Mars 2012
Recrudescence de cas de tularémie dans le Pas-de-Calais (Bois d’Habarcq)
En 2010, une épizootie de tularémie du lièvre avait été déclarée dans le bois d’Habarcq, tuant une cinquantaine de lièvres.
En 2011, dans ce même bois, une dizaine de lièvres trouvés morts a été signalée. Un seul individu était exploitable et l’autopsie a révélé que la cause de la mort était la tularémie. L’entretien de l’épizootie était probablement lié à l’activité des tiques, pendant une période de redoux.
Une étude est programmée pour évaluer la prévalence de F. tularensis dans la population de tiques du bois et identifier les espèces de tiques responsables de la transmission.
Date : Janvier - février 2012
Recrudescence de cas de tularémie du lièvre dans l’Oise
Du 4 janvier au 7 février 2012, 6 lièvres sur 9 collectés dans l’Oise sont morts de tularémie, à une période de faible activité vectorielle. Les cas se sont déclarés sur des sites éloignés à quelques jours d’intervalle.
La maladie semble « ré-émerger » dans le département puisqu’elle n’avait pas été diagnostiquée depuis 2007. L’information a été relayée par la FDC60 à l’Agence régionale de Santé. Un autre lièvre vient d’être découvert, l’autopsie et une analyse histologique sont en cours pour essayer de cerner la voie d’exposition.
Date : Janvier 2012
Episode de papillomatose chez le cerf élaphe dans les Alpes-Maritimes
En octobre 2011, une dizaine de cerfs et biches du même groupe, présentant des tumeurs de tailles variables a été observée et photographiée par un naturaliste, Jean-Paul Daniel, dans la vallée du Haut-Var. Cette vallée abrite une population de 500 individus d’après le recensement de 2009 et est issue d’une extension naturelle depuis la population de cerfs de la vallée voisine. On observe toujours des échanges réguliers entre les deux populations.
En janvier 2012, des prélèvements de tumeurs sur un daguet ont pu être réalisés dans la vallée de la Haute-Tinée par la FDC06. L’examen histologique a révélé des lésions tumorales compatibles avec des fibropapillomes, d’origine probablement virale. L’origine de la contamination reste inconnue. Au vu de ce premier résultat, une information sera diffusée auprès de l’ensemble des sociétés de chasse du département bénéficiant d’une attribution cerf afin d’appréhender au mieux l’importance de cette maladie virale dans les Alpes-Maritimes.
Date : Janvier 2012
Mortalité groupée de bergeronnettes grises
En Dordogne, 18 bergeronnettes grises ont été découvertes mortes début janvier, dans et à proximité d’un hangar désaffecté.
Les oiseaux étaient en bon état physiologique. Il semblerait qu’ils aient chuté de perchoirs situés sous le toit du hangar.
Une campagne de destruction de rongeurs avaient été organisée récemment à l’extérieur du bâtiment. L’autopsie a révélé des hémorragies internes chez certains sujets.
Les analyses n’ont pas permis de mettre en évidence la présence d’anticoagulant dans les échantillons.
Date : Janvier 2012
Intoxication à la bromadiolone dans le Doubs
En 2011 dans le Doubs, 8 mammifères sauvages (sangliers, renards) ont été autopsiés dans le cadre du suivi des effets non intentionnels liés à l’utilisation agricole de la bromadiolone. Les résultats toxicologiques confrontés aux tableaux nécropsiques confirment une intoxication par la bromadiolone. En 2012, 3 fortes suspicions d’intoxication de renards et sangliers par un anticoagulant ont été rapportées. Les suspicions reposent sur les commémoratifs et le tableau lésionnel, des analyses toxicologiques sont en cours pour vérifier cette hypothèse.
Date : Octobre 2011
Deux lynx trouvés morts dans le Doubs
En octobre 2011, deux lynx d’Eurasie (Lynx lynx) femelles - une jeune et une adulte - ont été découvertes mortes dans le Doubs, percutées par une voiture. Elles ont été retrouvées mortes à une semaine d’intervalle, sur des sites distants de plusieurs dizaines de kilomètres. Cela porte à 3 le nombre d’individus trouvés morts en 2011 dans le Doubs. Les autopsies ont été réalisées dans le cadre du réseau Loup-Lynx en partenariat avec le réseau SAGIR
Date : Octobre 2011
Un grand tétras trouvé mort dans le Doubs
En octobre 2011, un grand tétras (Tetrao urogallus) a été découvert mort par les agents de l’Office National des Forêts et confié au réseau SAGIR. Ce mâle de l’année a été découvert dans une zone boisée dans laquelle aucun indice de présence n’avait été rapporté depuis plusieurs années. Cette espèce est protégée en Franche Comté. Les radiographies et l’autopsie confirment la mort de l’individu suite à un tir de l’animal en plein vol et laissent suspecter un acte de malveillance.
Date : décembre 2011
Epizootie chez les mésanges en Seine et Marne.
Début décembre 2011, une épizootie a été signalée en Seine et Marne. Elle touche principalement les mésanges sp. Les oiseaux ont été observés avec des lésions cutanées autour des yeux. Plusieurs étiologies peuvent expliquer ces lésions, parmi lesquelles la variole aviaire.
Des investigations sont en cours pour les discriminer.
Date : décembre 2011
Intoxication à la bromadiolone dans le Puy de Dôme.
En novembre 2011, trois milans royaux ont été découverts morts dans le Puy de Dôme par les agents de la Direction régionale de l’alimentation, de l’agriculture et de la forêt d’Auvergne. Ils ont été confiés au réseau SAGIR dans le cadre de la surveillance des effets non intentionnels de la bromadiolone, ainsi que quatre autres oiseaux sur dix-huit observés par la Ligue pour la protection des oiseaux. Les lésions et les résultats toxicologiques confirment l’intoxication. Vu la confirmation de l’intoxication à la bromadiolone, la lutte contre les campagnols terrestres a été suspendue dans plusieurs commune par arrêté préfectoral.
Date : novembre 2011
Tour de France SAGIR 2011.
Du 19 octobre au 23 novembre 2011 ont eu lieu les réunions régionales SAGIR à Montpellier (34), Bouchemaine (49), Saint-Lô (50), Chéreng (59), Auffargis (78), Bar-Le-Duc (55), Dijon (21), La Tour de Salvagny (69), Limoges (87) et Auch (32). Rendez-vous des animateurs du réseau dans chaque département, des techniciens et vétérinaires des laboratoires départementaux d’analyses vétérinaires, du responsable scientifique et de l’administrateur national du réseau, les réunions ont permis de faire le point sur les actualités sanitaires, les faits marquants du réseau enregistrés en 2010 et 2011 ainsi que sur le programme pluriannuel d’actions pour la modernisation de la gestion des données du réseau et le renforcement de la performance des outils de traitement des données épidémiologiques.
Date : novembre 2011
Intoxication de perdrix grises par les semences de blé traitées à l’imidaclopride.
Dans le département de l’Eure-et-Loir, le réseau SAGIR, en lien avec le programme de recherche PeGASE, a mis en évidence de nouveaux cas d’intoxication de perdrix grise due à l’exposition des oiseaux aux grains de blé traités à l’imidaclopride au moment des semis. Les analyses réalisées sur les spécimens trouvés morts ou capturés malades avec des signes neurologiques ont montré la présence de la molécule dans les tissus des animaux analysés. Ces cas s’ajoutent aux 71 foyers répertoriés par SAGIR depuis 1995, concernant près de 500 spécimens. Ces foyers sont tous en relation avec une exposition des oiseaux sauvages à l’imidaclopride, molécule dont la toxicité aiguë pour les oiseaux est avérée.
Date : octobre 2011
Mortalité massive dans le Maine-et-Loire due aux cyanobactéries.
Depuis la fin de l’été, une importante mortalité d’animaux sauvages est observée dans le Maine-et-Loire. A ce jour, 1000 cadavres répartis sur 5 étangs ont été découverts. Les espèces principalement concernées sont le canard colvert, le canard chipeau, la sarcelle d’été, la sarcelle d’hiver, le fuligule milouin, la foulque macroule. Le cygne tuberculé, l’aigrette garzette, la buse variable, le héron cendré sont également touchés. Deux chevreuils ont également été découverts morts. Les analyses réalisées dans le cadre du réseau SAGIR ont déterminé avec certitude que ces animaux étaient morts d’une intoxination aux microcystines produites par des cyanobactéries du genre Microcystis.
Date : octobre 2011
Comportement anormal de perdrix grises associée aux semis de céréales d’hiver.
Dans le département de l’Eure-et-Loir, quatre perdrix grises ont été observées avec un comportement anormal dans une parcelle nouvellement semée en blé. Les oiseaux se sont envolés et, après quelques secondes, sont tombés au sol. Elles ont poursuivi leur fuite à pattes. L’une des perdrix a été capturée afin de réaliser des analyses vétérinaires. Ces analyses vont notamment cibler le produit phytopharmaceutique utilisé en enrobage de semence de blé dans ce cas précis ainsi que le molluscicide qui était associé au semis. Les résultats seront connus dans quelques jours.
Date : octobre 2011
Foyer de mortalité en Haute-Garonne.
Dans le département de Haute-Garonne, sur un territoire de chasse, 10 lièvres d’Europe, 20 pigeons ramiers et 2 chevreuils ont été découverts morts. Aucun de ces animaux n’a pu être analysé.
Date : octobre 2011
Découverte d’un aigle botté mort en Lozère.
Un aigle botté a été trouvé mort par un observateur de l’Association Lozérienne pour l’Etude et la Protection de l’Environnement ALEPE.
Le cadavre a été pris en charge par le réseau SAGIR dans le cadre de la convention liant la Fédération départementale des chasseurs de Lozère, l’Office national de la chasse et de la faune sauvage, ALEPE, la LPO et le Parc national des Cévennes.
Les investigations vétérinaires sont en cours au laboratoire départemental d’analyses vétérinaires pour identifier la cause de la mort.
Date : octobre 2011
Test d’une nouvelle méthode en toxicovigilance.
La mise au point d’une méthodologie de surveillance des effets des pesticides en nature devrait permettre d’effectuer des études ciblées en cas de détection d’un événement toxicologique SAGIR de grande ampleur et de conclure sur l’importance des cas détectés par le réseau. Une étude est donc actuellement menée dans l’Eure-et-Loir sur la surveillance des effets du méthiocarbe. Un premier volet vise à tester sur le terrain la recherche de cadavres en ciblant des parcelles traitées et en prenant en compte la probabilité de détection et le taux de disparition des cadavres. Pour cela, des cadavres sont placés le long de transects dans les champs parcourus par des observateurs. Le nombre de cadavres observé permet d’obtenir la probabilité de détection. Un relevé quotidien est ensuite effectué pour déterminer le taux de disparition des cadavres. Ces paramètres vont alimenter des modèles informatiques qui permettront de calculer la proportion de cadavres détectés dans le cadre d’une vigilance renforcée par rapport au nombre total de cadavres réellement présent.
SAGIR est un réseau de surveillance en continu des maladies de la faune sauvage. Tout au long de l’année, il enregistre des épisodes de maladie ou de mortalité chez les oiseaux et les mammifères sauvages. Cette page présente chronologiquement les événements détectés par le réseau SAGIR, rapportés par les interlocuteurs techniques départementaux.
Date : septembre 2011
Epizootie chez le moineau domestique en Camargue.
Une épizootie a été signalée en Camargue, affectant principalement le moineau domestique Passer domesticus et dans une moindre mesure le bruant des roseaux Emberiza schoeniclus. 80 % des jeunes de l’année seraient touchés d’après une première estimation de terrain. Les animaux sont plus faibles et ne font pas leur mue comme les autres. Des lésions cutanées apparaissent sur l’ensemble du corps : tête surtout au niveau des yeux, narines, articulations... Plusieurs étiologies peuvent être à l’origine de ces lésions, parmi lesquelles la variole aviaire. Des investigations sont en cours pour les discriminer.
Date : septembre 2011
200 oiseaux morts dans le Tarn-et-Garonne.
Fin août 2011, près de 200 oiseaux ont été trouvés morts ou observés malades dans le Tarn-et-Garonne. Les animaux présentaient des troubles neurologiques avec incoordination motrice, difficultés à fuir et phases de somnolence. Les espèces principalement touchées étaient les colombidés. Des passereaux ont également été trouvés morts et un busard Saint-Martin a été observé avec des signes neurologiques similaires. Deux blaireaux ont également été découverts morts à proximité. Des investigations sont en cours dans le cadre du protocole SAGIR, en particulier des analyses toxicologiques compte tenu du contexte épidémiologique et des observations cliniques.
Date : juillet-août 2011
Mortalité de sangliers et de ragondins dans les Côtes d’Armor.
En juillet et août 2011, des cadavres de sangliers et de ragondins ont été découverts dans l’estuaire du Gouessant, dans les Côtes d’Armor. Tous les résultats des investigations sont dans le rapport de l’ANSES disponible sur le site de l’agence.
Mise à jour le 24/01/2013
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Lun 28 Jan 2013 - 19:23
